Claude, 64시간 만에 전갈 신경독 바인더 17개 설계 및 실험 검증

• Claude가 전갈 신경독에 결합하는 17개의 단백질 바인더를 설계했으며, Adaptyv Bio와 Twist Bioscience의 실험적 테스트를 통해 검증됨
• AI 모델이 64시간 동안 318,484개의 단백질 설계를 생성하고 180개를 실험실 테스트에 선정했으며, 최종 211개 중 17개가 엄격한 결합 기준을 충족함
• 가장 강력한 바인더(Cn2-B1, Cn2-B2)는 Cn2 독소에 대해 단일 자리 나노몰(nanomolar) 친화도를 달성했으며, 알려진 중화 항체가 표적하는 것과 동일한 부위를 표적으로 삼을 가능성이 있음
• 전갈 항독소 및 기타 방치된 질병 연구 가속화를 위해 211개 설계 및 실험 데이터가 공개됨

설계 방법론

• Claude는 12개의 설계 도구를 활용하고 약 10,000 GPU 시간을 소모하여 설계를 생성 및 필터링하는 높은 자율성으로 작동함
• 캠페인은 4개 지리적 지역에서 유래한 5가지 특정 신경독(Cn2, Ts1, AaH I, AaH II, LqhIII)의 나트륨 채널 결합 부위를 표적으로 삼음
• 여러 독소를 동시에 표적하는 멀티톡신 바인더는 결합 기준을 충족하지 못했으며, 성공은 단일 독소 표적으로 제한됨

검증 및 한계

• 결합은 세포-free 시스템과 포유류 세포 융합이라는 두 가지 보완적 실험실 포맷에서 표면 플라즈몬 공명(SPR)을 통해 측정됨
• 세포 환경 또는 살아있는 동물에서의 중화 작용을 테스트하지 않아, 해당 설계가 기능적인 항독소인지 아직 확인되지 않음
• 향후 단계로는 정제된 독소와의 결합 확인 및 치료제 개발 전 쥐에서의 효능 테스트 포함