RFD4-Proteina, GPU 1시간당 76.40개 유효 단백질 디자인 생성

• NVIDIA와 워싱턴대 단백질 설계 연구소(IPD)가 Hugging Face Spaces에서 오픈 소스 BioNeMo 모델 RFD4-Proteina를 공개함
• 24개 단백질 결합 표적 벤치마크에서 고(高) 사고(thinking) 설정 적용 시 GPU 1시간당 계산 기준을 충족하는 구조적으로 구별되는 디자인 76.40개를 생성함
• 이는 2위 방법인 Proteina-Complexa의 GPU 1시간당 13.24개 대비 현저히 높은 성능임
• 시퀀스와 전 원자(all-atom) 구조 생성을 단일 flow-matching 아키텍처에 통합하여 핸드오프 과정의 정보 손실을 줄임

Technical Architecture

• 아미노산, 뉴클레오티드, 화학적 동일성(chemical identities)을 잠재 벡터로 인코딩하는 오토인코더와 flow-matching 모델을 결합함
• 다른 단백질, 소분자, 핵산, 변형 아미노산이 포함된 복잡한 분자 환경에서의 생성을 지원함
• 디자인 정제 품질과 계산 비용 간 균형을 위해 'Thinking setting'(low, medium, high)을 제공함

Availability and Workflow

• 2026년 10월 21일부터 11월 4일까지 NVIDIA RTX PRO 6000 GPU 기반 전용 Space의 무료 액세스를 후원함
• 후원 종료 후 전용 Space는 유료화되나, Hugging Face 계정 한도 내 ZeroGPU 공유 용량 Space는 계속 무료임
• Linux x86_64, Python 3.12, CUDA 13 호환 드라이버가 필요하며, 명령줄, Python 스크립트, Diffusers 라이브러리를 통한 프로그래매틱 생성을 지원함