CASP-DREAM TAP 챌린지, 5,800개 미확인 조합으로 T세포 활성화 예측
CASP-DREAM TAP Challenge: TCR + peptide-MHC activation prediction with unseen test peptides [N]
·2026.11.07 05:22
핵심 내용
CASP-DREAM TAP 챌린지가 5,800개 미확인 펩타이드 조합으로 T세포 활성화 예측을 평가한다.
자세히 보기
- CASP-DREAM TAP 챌린지 시작, TCR 시퀀스와 펩타이드-HLA 입력을 기반으로 T세포 활성화 예측 모델 개발 요구함
- 5,800개 라벨링된 조합으로 구성된 벤치마크, AUROC 지표로 평가함
- 테스트 펩타이드는 공개된 TCR 특이성을 가진 펩타이드와 최소 4회 편집(Levenshtein distance) 이상 차이가 나는 엄격한 미확인 데이터로 정의함
- 학습 데이터로는 공개 VDJdb 데이터베이스와 Adaptive Biotechnologies의 Harell Data 독점 TCR 데이터셋 사용 가능함
- Synapse를 통해 등록 접수 중
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